Petit village de l'Ain dans la région du Rhône-Alpes, Hotonnes fait partie du canton de Brénod., proche des Alpes dans le Jura  du Sud

Située à 1 164 mètres d'altitude et voisine des communes de Ruffieu et de Songieu, 312 habitants résident sur la commune d'Hotonnes sur une superficie de 28,4 km² (soit 11,0 hab/km²).

La plus grande ville à proximité d'Hotonnes est la ville de Bellegarde-sur-Valserine située au Nord-Est de la commune à 16 km. La rivière le séran est le principal cours d'eau qui traverse le village d'Hotonnes.